本专业是为适应我国经济社会发展的需要，满足战略性新兴产业生物医药的发展对人才的需求而新设的专业。
主要依托浙江省生物医学工程重中之重学科、浙江省家蚕生物反应器和生物医药重点实验室及浙江省生物科学实验教学示范中心建设点，具有雄厚的师资队伍和专业技术资源。
本专业设生物工程制药和天然药物两个培养方向，培养具有较好的人文社会科学素养和自然科学的基本理论知识，必备的专业基础理论和实践能力，有较强的生物制药理论基础与实践技能，具有创新意识，了解学科和产业发展趋势，能在生物医药、生物制品及相关领域从事研发、质控、生产等工作，并具有一定营销、管理等知识的复合型高级专业人才。
主要课程有：生物制药导论、生物化学、基因工程、药理学、免疫学、生物制药工艺学、微生物制药、生物技术药物学、天然药物化学、药物分析等。
毕业生能在生物制药、生物制品、天然药物、畜用生物制品、制药设备、生物农药等生物医药相应领域的企事业单位从事与生物制药技术相关的科学研究、技术开发、质量控制、产品营销、企业管理等方面的工作。
本专业在本校相应有生物学一级学科硕士点。