临床工程技术专业是由我校与日本滋庆教育集团合作创办的中外合作办学专业。
专业课程教学由中日双方教师共同承担，经过合作双方的共同努力，现已建立了系统的人才培养体系和完整的教学设施。
学生在校期间有为期一个月的赴日专业研修机会。
专业优秀学生除可享受学校综合奖学金外，还可享受“桥本”奖学金和赴日研修资助。
学生在我校学习获得的学分，得到日本厚生省的承认。
毕业后可赴日本合作学校留学深造，参加日本“临床工学技士”国家考试，取得临床工程师职业资格，享受日本学生同等待遇。
修学期满、成绩合格，除获得上海医疗器械高等专科学校毕业证书外，还可获得日本大阪高技术专门学校颁发的结业证书。
临床工程技术（中日合作）培养目标医工结合、以工为主，具有掌握重要医疗仪器设备，主要包括手术室、ICU设备、血液透析中心等(如人工心肺机、呼吸机、血液透析机等)生命支持设备的操作、使用、维护、功能开发和技术管理的职业技能，掌握现代临床医疗仪器发展的复合型临床工程技术人才。
特色课程医用诊断仪器、医用治疗仪器、人体机能替代装置、人体信息及其测量技术、临床工程课题研究、医用机器安全管理学、医院见习、短期赴日研修(其中优秀学生可得到学校资助)、毕业实践等。
就业方向主要面向各级医院临床工程技术部门(手术室、ICU、血液透析中心、设备维护管理部门等)从事生命替代装置如呼吸机、人工心肺机、血液透析机及患者监护设备等的操作使用、维修、功能开发和技术管理等，确保仪器设备在临床使用中的安全性和有效性；也可在中外医疗器械企、事业单位中承担产品辅助开发、生产制造、营销服务和技术管理等工作。
临床工程技术(中日合作医疗电子工程)培养目标本专业培养具备医学、电子及计算机基本理论知识，掌握常用医疗设备的临床应用、设备维护、局部设计、生产管理、性能检测等技能的高素质应用型专门人才。
特色课程日语、临床医学总论、医电产品分析与制作、单片机技术应用与实践、医用电子设备、人体机能替代装置、医学影像设备、医用电气安全技术、医院见习、医用电子仪器修理工认证实训、短期赴日研修（其中优秀学生可得到学校资助）等。
就业方向毕业生主要在医疗事业单位和医疗器械相关企业从事医疗设备的临床应用、维护、检测、设计和管理等工作；毕业生可申请赴日方留学深造，获得日本临床工学技士国家资格和就业机会。